Кафедра анатомии, акушерства и хирургии берет свое начало с 1959 года с организацией зоотехнического факультета Куйбышевского СХИ. Первым заведующим кафедрой был кандидат биологических наук, доцент Миняев Г.И. (1959-1969 гг).
Для работы на кафедру из Оренбургского СХИ были приглашены: кандидат биологических наук, доцент Дедашев Я.П. для преподавания курса «Физиология сельскохозяйственных животных» который в 1969 г. защитил докторскую диссертацию на соискание ученой степени – доктор биологических наук). Ассистентом кафедры был ветврач Сафонов Н.Ф., который в 1967 г. защитил кандидатскую диссертацию на соискание учёной степени кандидата ветеринарных наук. Ст. лаборантом кафедры работал ветврач Гурьев Н.Д.
В 1960 г. для работы на кафедру были приняты: кандидат биологических наук Серых М.М. который в 1969 г. защитил докторскую диссертацию на соискание ученой степени доктора биологических наук по специальности «Физиология животных» и кандидат ветеринарных наук Суханов Н.П., которые вели курсы акушерства и искусственного осеменения сельскохозяйственных животных, основы ветеринарии, зоогигиены, биохимии. В 1963 г. кафедру анатомии разделили на две самостоятельные кафедры анатомии и ветеринарии.
С 1969 по 1978 гг. кафедру возглавляла доктор биологических наук, профессор Стулова О.П., а с 1978 по 1979 гг. заведовал кафедрой анатомии доцент, кандидат биологических наук Минеев В.С. с 1979 по 1996 гг заведовал кафедрой анатомии доцент, кандидат ветеринарных наук Куропаткин Н.А. С 1996 по 1999 гг. кафедру анатомии и ветеринарии вновь объединили в кафедру «Ветеринарии и морфологии» заведовал кафедрой доктор ветеринарных наук, профессор Петров А.М.
3 мая 2000 г. в связи с открытием в 1998 г. специальности 310800 «Ветеринария» была организована кафедра «Анатомия, акушерство и хирургия». Заведующий кафедрой доктор биологических наук, профессор, Заслуженный деятель науки РФ, почётный работник ВПО РФ, почётный работник АПК РФ, кавалер ордена почёта – Баймишев Хамидулла Балтуханович который работает на кафедре с 1977 года (ассистент, доцент, профессор, заведующий кафедрой).
В настоящее время на кафедре работают: профессор, доктор ветеринарных наук Баймишев М.Х., доцент, кандидат ветеринарных наук Ненашев И.В., доцент, кандидат сельскохозяйственных наук Минюк Л.А., доцент, кандидат ветеринарных наук Землянкин В.В., доцент, кандидат сельскохозяйственных наук Нечаев А.В., доцент, кандидат биологических наук Шарипова Д.Ю., доцент, кандидат биологических наук Курлыкова Ю.А., старший преподаватель Ильичёв В.Н., старший лаборант Алкарева С.В.; лаборанты: к.в.н. Пристяжнюк О.Н., Груняева С.М.
В разные годы на кафедре работали доценты, кандидаты биологических наук: Герасимов С.Б., Григорьев В.С., Трифонов Г.А., старший преподаватель Груданова Р.К., доцент, кандидат ветеринарных наук Салимова Н.П., доцент, кандидат биологических наук, Подгорнова Е.Д., доцент, доктор ветеринарных наук Савинков А.В., старший преподаватель, кандидат сельскохозяйственных наук Якименко Л.А., лаборанты: Колодкина Т.А., Пристяжнюк Т.Н., Гаврилина Т.И., заведующий ветеринарной клиникой Фадеев А.И., ветврачи-ординаторы Воронин В.Г., Алексеев А.С., квалифицированный рабочий Фокина Ю.И.
Кафедра проводит занятия обучающихся по направлениям: специалитет 36.05.01 «Ветеринария», бакалавриат 36.03.02 «Зоотехния», 06.03.01 «Биология», 35.03.07 «Технология производства и переработки сельскохозяйственной продукции».
На кафедре изучаются дисциплины: цитология, гистология и эмбриология; анатомия животных; морфология и физиология сельскохозяйственных животных; акушерство и гинекология; биотехника воспроизводства с основами акушерства; инструментальные методы диагностики; общая и частная хирургия; оперативная хирургия с топографической анатомией; деонтология; ветеринарная экология; клиническая диагностика, акушерские и хирургические болезни мелких животных; биология размножения и развития; внутренние незаразные болезни; диетология; морфология животных; анатомия и гистология собак и кошек; деонтология; цитология; гистология; анестезиология.
На кафедре разработан курс по выбору: «Инновационные методы биотехники размножения» и программа дуального обучения в базовых хозяйствах ФГБОУ ВО Самарский ГАУ: СХП ООО «ЭкоПродукт», ГУП СО «Купинское», АО «Нива», СХП «Ольгинский ОП Новокуровское», АО «Красный Ключ», ООО «Радна», «Тимашевская птицефабрика», ведётся подготовка обучающихся отделения ветеринарной медицины по специализации «Болезни мелких домашних животных». В 2019 году на кафедре анатомии совместно с центром инновационных технологий ФГБОУ ВО Самарский ГМУ подготовлен интерактивный 3D-атлас коровы который демонстрировался на Международной выставке «Зеленая неделя» в Германии в 2020 году и был отмечен дипломом лауреата. В 2015, 2021 гг на базе кафедры проведены две Международные научно-практические конференции по актуальным проблемам ветеринарной морфологии и биотехнологии посвященных 100-летию д.б.н., профессора И.В. Стуловой и 70-летию д.б.н., профессора Баймишева Х.Б. На базе кафедры в 2021 году проведен Всероссийский конкурс «Лучший по профессии» в номинации «Лучший ветеринарный фельдшер».
Основная научно-исследовательская тематика кафедры «Эколого-морфологическая адаптация и совершенствование методов диагностики, лечения, профилактики заболеваний животных в условиях интенсивной технологии содержания» № г\р АААА-А18-11812790027-1 руководитель - д.б.н. Баймишев Х.Б., исполнители - все сотрудники кафедры и студенты.
По итогам 20-летней научно-практической работы на кафедре создана «Инновационная технология воспроизводства крупного рогатого скота», которая была в 2015 г. отмечена на Всероссийском конкурсе по итогам НТС Министерства сельского хозяйства Российской Федерации, как лучшая апробированная технология в отрасли животноводства. Данная технология успешно внедряется в хозяйствах Самарской области. В 2019 году доцентом Баймишевым М.Х. подготовлена и успешно защищена докторская диссертация на тему «Научно-обоснованные приемы повышения репродуктивной функции высокопродуктивных коров» в диссертационном совете ФГБОУ ВО Санкт-Петербургской ГАВМ.
Кафедра имеет тесную связь с производством, что позволяет успешно проводить научно-исследовательские работы по бюджетной и хоздоговорной тематике. Основной темой научно-прикладных работ является «Разработка научно-обоснованных приёмов и организационно-технологических, профилактических мероприятий по повышению эффективности животноводства в условиях интенсивной технологии производства молока» в хозяйствах Самарской области.
По результатам научно-исследовательской работы издано 13 монографий, учебное пособие «Анатомия животных» утвержден ФУМО РФ в качестве учебника для подготовки обучающихся по специальности «Ветеринария» и направлению «Зоотехния» и технология производства продукции животноводства в 2021 году, а также 19 учебных пособий издано с грифом УМО, опубликовано 25 статей в Scopus и 12 статей входящих в базу данных WebofScains, в том числе 4 статьи в Международных журналах Q1, 272 статей входящих, в перечень рецензируемых журналах ВАК и 530 – РИНЦ.
Количество научных студенческих кружков, секций на кафедре – 6: «Анатом», «Акушер», «Клетка», «Хирург», «Морфолог», «Клиницист». Научными руководителями являются: Баймишев Х.Б., Шарипова Д.Ю., Минюк Л.А., Ненашев И. В., Нечаев А.В., Землянкин В.В., Курлыкова Ю.А., Баймишев М.Х.
Ежегодно в НИР кафедры участвует 30-35 студентов, которые принимают участие в выполнении научных исследований по госбюджетной и хоздоговорной тематике кафедры. Ежегодно студенты-кружковцы кафедры выступают с докладами на конференциях академии, областной студенческой конференции, в конференциях других вузов. Ежегодно совместно со студентами преподаватели кафедры опубликовывают более 20 статей входящих в РИНЦ, ВАК, Scopus. К научной работе студенты привлекаются с первого курса, выполняя реферативные и экспериментальные работы по морфологии животных. По результатам конференций студенческие работы отмечены почетными грамотами, благодарностями, дипломами.
В 2020 году научная работа студентки Афанасьевой А.С. на Международной научно-практической конференции среди научных работ в г. Ижевске заняла I место (руководитель профессор Баймишев Х.Б.).
На кафедре работает аспирантура по двум специальностям:
06.02.01 – диагностика болезней и терапия животных, патология, онкология и морфология животных;
06.02.06 – ветеринарное акушерство и биотехника репродукции животных.
За весь период на кафедре подготовлено 4 доктора наук и 24 кандидата наук. Руководство аспирантурой осуществляют: д.б.н., профессор Баймишева Х.Б. и д.в.н., профессор Баймишев М.Х.
В настоящее время на кафедре 4 аспиранта очного обучения: Петухова Е.И., Гонури Четан Кумар, Андреева А.А.; 1 аспирант заочного обучения – Теняков В.А.